复方门冬滴眼液属于非处方药，其禁忌人群主要有对成分过敏者、急性闭角型青光眼患者、严重肝功能不全者、孕妇及哺乳期妇女、儿童等。建议在医生或药师指导下使用。
复方门冬滴眼液主要含有门冬氨酸、维生素B6、甘草酸二钾等成分。若使用者曾对这些成分产生过敏反应，如眼部红肿、瘙痒、皮疹等，应禁止使用该药物。过敏体质者在使用前需仔细阅读说明书，必要时进行皮肤测试，以避免引发更严重的过敏反应。
二、急性闭角型青光眼患者虽然复方门冬滴眼液主要用于缓解视疲劳和干涩症状，但部分含血管收缩剂或影响房水代谢的成分可能加重眼压波动。急性闭角型青光眼患者本身存在房水排出障碍，使用此类滴眼液可能导致眼压进一步升高，诱发剧烈头痛、恶心呕吐甚至视力急剧下降，因此应严格禁用。
复方门冬滴眼液中的某些辅料或活性成分经局部吸收后仍需通过肝脏代谢。对于已有严重肝功能损害的患者，即使微量入血也可能增加肝脏负担，延缓药物清除，导致体内蓄积风险上升。此类人群应在专科医师评估后方可决定是否使用，通常建议优先选择无肝代谢依赖的眼用制剂。
四、孕妇及哺乳期妇女目前尚无充分临床研究证实复方门冬滴眼液在妊娠期和哺乳期的安全性。尽管外用滴眼液全身吸收量较少，但出于谨慎原则，孕妇尤其是妊娠早期女性应避免使用，以防潜在致畸风险；哺乳期妇女使用后可能通过泪囊-鼻腔黏膜途径少量进入血液循环并经乳汁分泌，故也应慎用或在暂停哺乳的前提下短期使用。
儿童眼球结构尚未发育完全，角膜较薄、泪液分泌量少，对药物敏感性高于成人。复方门冬滴眼液未针对儿童群体开展系统安全性试验，且部分防腐剂成分可能对儿童眼表造成刺激或损伤。除非有明确儿科眼科医嘱，否则不建议自行给儿童使用该药，日常护眼应侧重于用眼卫生与户外活动。
