天生弱视的病因主要有屈光不正、斜视、形觉剥夺、双眼相互作用异常、遗传因素。
屈光不正是导致先天性弱视最常见的原因，包括高度远视、高度散光以及高度近视。当眼球在发育早期存在显著的屈光误差时，视网膜上无法形成清晰聚焦的图像，大脑视觉中枢长期接收模糊信号，导致视觉发育停滞或退化。这种情况往往具有双侧性，若两眼度数差异较大，则可能引发屈光参差性弱视，使度数较高的一只眼视力受损更为严重。
二、斜视：斜视也是引起弱视的重要病理机制之一。当眼位出现偏斜时，两眼注视同一目标会产生复视或混淆视，为了消除这种不适感，大脑会主动抑制来自斜视眼的视觉输入。长期的神经抑制会导致该眼黄斑中心凹功能退化，进而形成斜视性弱视。这类弱视通常发生在单眼，且与斜视的类型和持续时间密切相关，若不及时干预，视力损害可能不可逆。
形觉剥夺是指由于眼部结构异常阻碍了光线进入眼内，导致视网膜缺乏有效的光刺激。常见的先天性疾病如先天性白内障、先天性青光眼、上睑下垂等，都会遮挡瞳孔区或改变眼内环境，使得婴幼儿期关键视觉发育阶段得不到正常的光影信息输入。这种类型的弱视程度通常较重，且治疗窗口期紧迫，需要尽早通过手术解除剥夺因素并配合后续视觉训练。
四、双眼相互作用异常：双眼相互作用异常涉及视觉皮层神经元对双眼输入信号的整合障碍。在正常发育过程中，双眼需要协同工作以建立立体视。若因先天神经连接缺陷或早期视觉经验不足，导致双眼竞争失衡，优势眼会压制非优势眼的信号传递。这种神经层面的抑制不仅影响单眼视力，还会破坏双眼视功能的建立，表现为融合困难或立体视缺失，是功能性弱视形成的深层神经机制。
部分弱视患者存在明确的家族聚集现象，提示遗传因素在发病中起作用。某些基因变异可能影响眼球结构的正常发育、晶状体透明度维持或视觉神经通路的成熟过程。虽然弱视本身不是直接的单基因遗传病，但易感性可通过遗传获得，例如父母有高度屈光不正或斜视史，子女发生弱视的概率显著增加。了解家族病史有助于早期筛查和高危人群的预防管理。
