AI模型发现人体中“隐形”蛋白质TM184C

科技日报北京9月15日电 (记者刘霞)美国科学家在最新一期《自然》杂志发表论文称,他们借助人工智能(AI)模型,发现了人体中“隐形”的蛋白质,并揭示了其真实用途。这为理解细胞如何“交流”、如何在压力下生存,以及疾病如何发生,打开了新思路。

几十年来,科学家多以蛋白质序列为线索研究蛋白质生物学,这一次,他们转向三维形状,以揭开蛋白质的秘密。

此次研究的主角是蛋白质TM184C。美国迈阿密大学米勒医学院西尔维斯特综合癌症中心团队借助AI模型,比较了超过2.14亿种蛋白质的预测形状,发现了G蛋白偶联受体(GPCR)家族中此前未被识别的成员。GPCR是一类帮助细胞感知并响应细胞外信号的蛋白。

在众多蛋白质中,TM184C格外引人注目。研究显示,它主要存在于细胞内囊泡(由脂质双分子层包裹、直径约30—100纳米的膜性小泡)中,与细胞应对压力、细胞间“交流”密切相关。

当TM184C被破坏时,细胞间连接减少,细胞形态和囊泡组织也随之改变,说明它参与构建并管理细胞间的“交流”。此外,TM184C似乎还参与调控自噬——细胞分解、回收老旧或受损成分的过程。这套“回收机制”可帮助细胞适应压力。研究中,TM184C减少时,自噬标志物增加,提示该蛋白参与调节这一过程。

团队表示,在癌症中,肿瘤细胞常在缺氧、缺营养的环境中生长。细胞间“交流”可让部分细胞共享资源,获得邻近细胞支援,另辟生路,也可能助推疾病进展。

团队还研究了一种与人类TM184C相似的酵母蛋白Hfl1。去除Hfl1后,酵母细胞出现异常,而加入人类TM184C后,这些异常竟得到修复。令人惊讶的是,历经约十亿年进化,酵母与人类仍保留着这一相似的重要功能。 

【总编辑圈点】

科学家借助AI,用了一种新方法寻找蛋白质。他们比对超过2亿种蛋白质的三维立体形状,发现了一种长期被忽视的人体蛋白TM184C。它承担双重角色:一方面参与细胞间的沟通连接,另一方面参与细胞的清洁,帮助细胞应对环境压力。而且,酵母中相似蛋白缺失后出现异常,放入人的TM184C就能修复,说明这项功能历经约十亿年进化仍被保留。该成果开辟了挖掘蛋白的新路径,也为理解肿瘤细胞在恶劣环境中的生存策略、寻找新的干预靶点提供了线索。

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