上海推出“病毒基因组检测分析平台” 疫情期间在线免费向社会开放

(抗击新冠肺炎)上海推出“病毒基因组检测分析平台” 疫情期间在线免费向社会开放

中新网上海1月8日电 (郑莹莹)据上海科技创新资源数据中心(以下简称:数据中心)8日发布的消息,由该中心与中国科学院上海巴斯德研究所联合打造的“病毒基因组检测分析平台”于2021年第一个工作周正式更新上线。该平台可进行病毒基因检测和进化分析,疫情期间面向社会提供在线免费服务。

据介绍,基因组测序是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一,有助疫情防控、开展各项诊疗。

该平台由数据中心与中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员、波兰华沙理工大学人工智能系主任诺瓦克教授等共同研发,于2020年2月疫情期间推出,经过更新迭代,目前该平台可同时兼容二代基因测序数据和纳米孔基因测序数据,用户只需上传样本数据,即可一键完成检测,在1小时内得到分析结果,以助更全面地进行病毒鉴定。

上海科技创新资源数据中心副总经理李敏介绍,相比传统的体外培养法和荧光PCR法,以及之前的二代病毒基因组鉴定与核酸检查,新型基因测序在临床病原微生物检测中的检测范围更广、准确率更高,而基于纳米孔测序的仪器也具有便携性强、测序速度快等优势,可以在不同级别的医院予以部署及使用。另外,数据中心基于遗传进化树研发进化分析模块,还力求实现“发现新型病毒、鉴定传播链条、发现超级传播者和指导用药方案”等功能。

据悉,上海科技创新资源数据中心还计划将三代测序分析平台下沉至社区医院等基层医疗机构,为其提供统一的在线分析平台服务。(完)

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