小儿推拿本身作为一种绿色疗法，在正规操作下通常没有明显的“坏处”，但如果操作不当、时机不对或适应症判断错误，可能会带来一些负面影响。主要风险包括皮肤损伤、加重病情、延误治疗以及引发其他不适。
这是最常见的问题。小儿皮肤娇嫩，角质层薄，如果推拿时用力过猛、手法粗糙、未使用介质如滑石粉、按摩油或介质干燥后强行摩擦，极易导致局部皮肤发红、破损甚至起水泡。若孩子哭闹剧烈、不配合，家长强行按压穴位，不仅会造成软组织挫伤，还会让孩子对推拿产生恐惧心理，增加后续护理难度。
二、加重原有病情并非所有疾病都适合推拿。例如，如果孩子患有急性传染病如水痘、麻疹、骨折、脱位、皮肤感染如脓疱疮、丹毒、出血性疾病如血小板减少性紫癜或恶性肿瘤，进行推拿可能会促进血液循环，导致炎症扩散、出血不止或肿瘤转移。特别是对于高热惊厥刚发作后的儿童，盲目推拿可能刺激神经系统，诱发再次抽搐。
部分家长过度迷信推拿的疗效，认为“包治百病”，在孩子出现严重症状如持续高烧不退、剧烈呕吐、意识模糊、呼吸急促时，仍坚持在家自行推拿，拒绝及时就医。这种做法可能导致肺炎、脑炎、肠套叠等急重症被漏诊或误诊，错过黄金抢救时间，造成不可逆的健康损害。
四、引发消化系统紊乱虽然推拿常用于调理脾胃，但若手法方向错误如补泻不分、频率过高或在饭后立即进行，反而可能干扰胃肠正常蠕动。例如，顺时针摩腹本意是通便，但对于腹泻患儿若误用此法，可能加重脱水；反之亦然。不当的刺激还可能引起孩子恶心、呕吐或腹痛加剧。
建议家长在进行小儿推拿前，务必先由专业中医师或儿科医生明确诊断，排除禁忌症。学习正确的手法、力度和介质使用，避免在宝宝饥饿、过饱、极度疲劳或情绪激动时进行操作。若推拿过程中孩子出现异常哭闹、面色改变或症状加重，应立即停止并寻求医疗帮助。
